R语言分析EyeLink数据

R 是一种用于统计计算和图形的编程语言，是可以用来处理和分析凝视和瞳孔测量数据的强大工具。

R 语言官方网站：https://cran.r-project.org/

使用R语言来分析EyeLink眼动仪数据

EyeLink 数据可以通过多种方式导入 R中：

1) 通过读取分析数据输出的报告。

在使用Data Viewer进行分析输出所需要的指标后，可将报告输出为制表符分隔的 ASCII 文件。当然也可以不作分析直接输出原始数据也是可行的，但这可能需要在R中再次筛选数据。

可以在Trial, Interest Area, Fixation, Saccade, and Sample Report中生成报告。每个报告可以包含许多不同的变量（列）。例如，在Trial Reports 中报告出BLINK_COUNT（试次眨眼次数）、FIXATION_COUNT（试次注视次数）、PUPIL_SIZE_MEAN（试次平均瞳孔大小）、PUPIL_SIZE_MAX（试次瞳孔最大）等会输出一个文件。然后使用R即可很轻松的读取该文件。

代码：

data <- read.table('trial.xls', sep = "\t", na.strings = ".", header = TRUE)

Data Viewer软件在Mac OS系统下输入格式.txt；在window系统下输出格式.xls，这两种格式对内容数据无任何影响。在这两种情况下，报告都是制表符分隔的 ASCII 文件。可以直接读取。

2) 通过EDF转ASCII的转换工具。

针对将原始数据的转换，首先需要安装该工具箱。

对于 macOS 和 Linux，EDF2ASC 的命令行和 GUI 版本，安装EyeLink Development Kit 包，即可查看。

对于 Windows，命令行版本与 Development Kit 在一起， GUI 版本 (VisualEDF2ASC) 需要安装 Data Viewer 软件。

可参考软件安装教程。

在R中已经有一些library包能直接解析转换输出的 ASCII 输出。（比如：eyelinker），对于教程学习，我推荐参考eyelinker的教程链接：https://cran.r-project.org/web/packages/eyelinker/vignettes/basics.html

3) 通过直接导入 EDF 文件。

EyeLink 数据文件（EDF 文件）是以二进制格式编码，但我们的 EDF-API（安装Development Kit）提供了可用于提取数据的工具。因此有许多包可以使用 EDF-API 将 EDF 文件直接读入 R。比如： eyelinkReader（由 Alexander Pastukhov 编写）可以使用，并且生成了一个非常易于使用的丰富数据结构。有关更多详细信息，包括安装说明，请查看以下链接：

https ://alexander-pastukhov.github.io/eyelinkReader/

由科学研究人员开发的R包来处理 EyeLink 数据。

很多包都可以再Github上查找关键字”EyeLink“即可搜索到。这些包是科研学者根据需求自己开发的，并没有经过SR Research团队进行测试，在此文章中列举仅供参考，不代表官方支持。对于包的使用有任何疑问，可直接联系开发者。

eyelinkReader：用于将 EDF 文件直接读取到 R 中的有用工具。
eyetrackingR：这个综合软件包包含用于准备和分析眼动数据（包括使用 EyeLink 眼动仪收集的数据）的有用工具。它采用Sample报告类型输入，特别适合视觉世界/时间序列分析。
GazeR：具有处理凝视和瞳孔数据的几个有用功能。它可以直接读取 EDF 文件，也可以解析转换为 ASCII 的 EDF 文件）。
popEye：一套全面的R函数，用于处理阅读数据。目前以 ASCII 数据作为输入。
pupillometryR:用于处理瞳孔数据的完整 CRAN 包。以 ASCII 数据作为输入。