近红外数据软件网址
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常见分析软件:
• Homer3
https://github.com/BUNPC/Homer3
Homer3是Matlab应用程序,用于分析fNIRS数据以获得大脑激活的估计图
资源介绍:https://www.bilibili.com/video/BV1Fg4y1q71J?from=search&seid=13706606535957346752
• Homer2
资源介绍:https://www.bilibili.com/video/BV1xJ411p7Et?from=search&seid=8514344839950252914
• NIRS-SPM
https://www.nitrc.org/projects/nirs_spm
资源介绍:B站搜索关键词“NIRS-SPM”
• FC-NIRS
https://www.nitrc.org/projects/fcnirs
FC-NIRS是用于近红外光谱数据的功能连通性分析工具,该软件包的功能包括预处理,质量控制,FC计算和网络分析。
资源介绍:B站搜索关键词“FC-NIRS”
• NIRS-KIT
https://github.com/bnuhouxin/NIRS_KIT
NIRS-KIT是基于Matlab的工具箱,用于任务和静止状态fNIRS数据分析。适合分析Hitachi和shimazhu的采集数据
资源介绍:https://github.com/bnuhouxin/NIRS_KIT/blob/master/NIRS_KIT_UserManual_HouXin.pptx
• NIRS-toolbox
https://github.com/huppertt/nirs-toolbox
NIRS-toolbox是匹兹堡大学的Huppert实验室建立的近红外数据分析工具箱。
资源介绍:https://bitbucket.org/huppertt/nirs-toolbox/wiki/Home
• MNE-Python
用于在Python下的分析MEG/EEG/fNIRS工具箱,可以使用读取NIRx记录mne.io.read_raw_nirx()
• BrainStorm3: https://neuroimage.usc.edu/brainstorm
• Nirstorm
https://github.com/Nirstorm/nirstorm
Nirstorm是基于brainstorm3插件的分析fnirs数据的工具。
一些近红外公司的软件(也是免费下载)
• Open PoTATo
https://github.com/hkwgc/open-potato
Open PoTATo是基于Hitachi,Ltd.开发的光学分析工具软件平台(通常称为POTATo)开发的。进行信号预处理,统计分析和可视化。
• NIRSlab
https://www.nitrc.org/projects/fnirs_downstate
NIRSlab是NIRX自带的光学分析平台。
预处理资源
此资源公开在GitHub上,遵守CC-BY-NC协议。
代码:https://github.com/smburns47/preprocessingfNIRS
视频:可查看BrainTechnology之前推送视频
近红外定位的参考
https://github.com/nirx/fOLD-public
该工具箱允许基于五种分割方法的解剖学界标的光极探头布置,也可以加载fMRI数据(NIfTI或ANALYZE)作为fNIRS光极位置。
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本文作者:Chen Rui
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